对标 AlphaFold3！字节跳动开源 Protenix-v1，树立生物分子预测新标杆

生物计算又迎来一支重量级开源力量。字节跳动近日发布了名为Protenix-v1的生物分子结构预测模型。该模型在完整对齐 AlphaFold3（AF3）核心能力的同时，基于 Apache 2.0 许可全面开放代码与模型参数，被认为打破了顶尖生物大模型的技术壁垒。

Protenix-v1的亮点在于全原子级 3D 结构预测能力，能精准处理蛋白质、核酸（DNA 与 RNA）以及小分子配体等复杂体系。按公开信息，这是首个在相同训练数据、模型规模和推理预算条件下，整体表现可与 AlphaFold3 持平并在多项基准上更进一步的全开源模型。为确保评测公平透明，字节跳动同步上线了PXMeter v1.0.0评测工具箱，覆盖 6000+ 复杂分子样本，便于复现实验基准。项目还提供基于浏览器的 Web 服务器，方便科研人员直接开展交互式研究。业内普遍认为，此次开源将显著加速药物研发与合成生物学等前沿方向的创新进展。